作为南水北调中线水源地的丹江口水库的水质状况，一直备受各方关注。权威机构长江流域水资源保护局多年的监测及调查结果表明，丹江口水库水质一直处于良好状态，可以满足作为调水水源地要求。
据水资源保护专家、长江流域水资源保护局局长翁立达介绍，该局所属长江流域水环境监测中心1995～1996年曾在丹江口水库中布设了7个断面，分丰、平、枯3个水期进行过全面的监测。按当时国家标准GB3838－88对氨氮、亚硝酸盐氮和硝酸盐氮的评价结果表明，水质符合I类，但当时标准中未包括总氮。
近年来，长江流域水环境监测网对水库坝上断面这3项指标的监测结果表明，水质并无明显变化。
翁立达认为，对丹江口水库水质的评价涉及到采样监测点的位置是否具有代表性、监测评价参数选择是否科学、以及评价标准及方法是否合理等问题。对丹江口这样的大面积水库只布置3个测点显然不够，缺乏应有的代表性。另外，仅以总氮一项测值来认定丹江口水库的水质为IV类水的合理性也值得商榷。硝酸盐是总氮的主要来源，丹江口水库中硝酸盐的含量水平远低于世界卫生组织、美国公共卫生协会等组织规定的饮用水标准，其他几项参数氨氮、亚硝酸盐氮也均符合有关标准。
翁立达指出，根据长江流域水资源保护局掌握的多年监测结果，丹江口水库内除神定河、老灌河、堵河、浪河等入库河流污染严重，河口及局部库湾水质超标外，水库总体水质一直处于良好状态，完全满足调水水源地要求。但是，鉴于南水北调中线工程水源地的水质保护的重要性，建议有关地区和部门应抓紧对库区郧阳造纸厂、东风轮胎厂等主要污染源及上述河流的治理，加大污染防治的力度，以确保丹江口水库的水质永远保持良好的状态。
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